Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms