Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl13P47963 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms