Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms