Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf5P43027 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms