Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd9P40240 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd9P40240 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms