Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fen1P39749 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fen1P39749 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fen1P39749 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms