Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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HmgclP38060 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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HmgclP38060 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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HmgclP38060 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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HmgclP38060 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HmgclP38060 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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HmgclP38060 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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HmgclP38060 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgclP38060 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgclP38060 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgclP38060 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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