Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfc1P35601 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms