Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6dP35459 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms