Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin1P35438 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin1P35438 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin1P35438 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin1P35438 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin1P35438 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms