Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptpn11P35235 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptpn11P35235 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms