Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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