Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kif5cP28738 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms