Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Etv4P28322 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms