Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms