Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms