Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd12P23812 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms