Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnnc2P20801 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms