Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fcer1aP20489 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fcer1aP20489 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fcer1aP20489 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fcer1aP20489 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcer1aP20489 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcer1aP20489 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcer1aP20489 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcer1aP20489 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcer1aP20489 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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