Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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