Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnc1P15388 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnc1P15388 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnc1P15388 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnc1P15388 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnc1P15388 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnc1P15388 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnc1P15388 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnc1P15388 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnc1P15388 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnc1P15388 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnc1P15388 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnc1P15388 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnc1P15388 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnc1P15388 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnc1P15388 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnc1P15388 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnc1P15388 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms