Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf1P15314 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Irf1P15314 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Irf1P15314 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf1P15314 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Irf1P15314 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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