Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54P14576 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp54P14576 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54P14576 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54P14576 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54P14576 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms