Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms