Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb1P12658 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb1P12658 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb1P12658 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb1P12658 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Calb1P12658 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms