Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrm1P12657 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms