Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spp1P10923 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spp1P10923 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spp1P10923 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spp1P10923 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spp1P10923 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spp1P10923 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spp1P10923 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spp1P10923 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spp1P10923 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms