Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tnp1P10856 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms