Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms