Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf1P09925 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Surf1P09925 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf1P09925 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf1P09925 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms