Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NefmP08553 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NefmP08553 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NefmP08553 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NefmP08553 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NefmP08553 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NefmP08553 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NefmP08553 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NefmP08553 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefmP08553 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefmP08553 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefmP08553 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefmP08553 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefmP08553 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefmP08553 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NefmP08553 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefmP08553 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefmP08553 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefmP08553 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefmP08553 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefmP08553 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefmP08553 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefmP08553 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefmP08553 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefmP08553 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefmP08553 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefmP08553 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NefmP08553 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NefmP08553 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NefmP08553 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NefmP08553 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NefmP08553 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NefmP08553 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NefmP08553 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NefmP08553 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NefmP08553 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NefmP08553 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NefmP08553 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefmP08553 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefmP08553 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefmP08553 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefmP08553 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefmP08553 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefmP08553 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefmP08553 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefmP08553 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefmP08553 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefmP08553 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefmP08553 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefmP08553 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefmP08553 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefmP08553 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefmP08553 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefmP08553 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefmP08553 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefmP08553 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefmP08553 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefmP08553 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefmP08553 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms