Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a2P08122 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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