Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Csn3P06796 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Csn3P06796 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms