Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9P06683 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9P06683 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9P06683 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9P06683 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9P06683 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C9P06683 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C9P06683 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9P06683 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9P06683 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9P06683 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9P06683 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9P06683 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9P06683 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms