Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tk1P04184 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tk1P04184 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tk1P04184 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tk1P04184 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tk1P04184 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tk1P04184 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tk1P04184 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tk1P04184 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tk1P04184 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tk1P04184 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tk1P04184 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tk1P04184 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms