Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01740 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01740 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01740 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01740 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01740 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01740 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01740 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01740 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms