Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01678 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01678 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01678 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01678 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01678 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01678 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01678 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01678 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01678 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01678 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01678 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01678 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01678 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01678 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01678 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01678 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01678 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01678 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01678 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01678 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms