Protein–RNA interactions for Protein: P01677

Ig kappa chain V-VI region TEPC 601/TEPC 191, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01677 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01677 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01677 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01677 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01677 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01677 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01677 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01677 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01677 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01677 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01677 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01677 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01677 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01677 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01677 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01677 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01677 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01677 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01677 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01677 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01677 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01677 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01677 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01677 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01677 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01677 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01677 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01677 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01677 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01677 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01677 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01677 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01677 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms