Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01648 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01648 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01648 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01648 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01648 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01648 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01648 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01648 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01648 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01648 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01648 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01648 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01648 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01648 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01648 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01648 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01648 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01648 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01648 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01648 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01648 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01648 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01648 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01648 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01648 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01648 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01648 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01648 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01648 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01648 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01648 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01648 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01648 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01648 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01648 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01648 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01648 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01648 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01648 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms