Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Sypl2O89104 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sypl2O89104 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms