Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MscO88940 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MscO88940 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MscO88940 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MscO88940 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
MscO88940 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
MscO88940 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
MscO88940 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
MscO88940 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
MscO88940 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
MscO88940 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
MscO88940 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms