Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dll3O88516 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dll3O88516 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms