Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dnmt3aO88508 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms