Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SfnO70456 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SfnO70456 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SfnO70456 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SfnO70456 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SfnO70456 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SfnO70456 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SfnO70456 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SfnO70456 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SfnO70456 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SfnO70456 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SfnO70456 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SfnO70456 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SfnO70456 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SfnO70456 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SfnO70456 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SfnO70456 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SfnO70456 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SfnO70456 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SfnO70456 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SfnO70456 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SfnO70456 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SfnO70456 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SfnO70456 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SfnO70456 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SfnO70456 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SfnO70456 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SfnO70456 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SfnO70456 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SfnO70456 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SfnO70456 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SfnO70456 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SfnO70456 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SfnO70456 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SfnO70456 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SfnO70456 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SfnO70456 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SfnO70456 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SfnO70456 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SfnO70456 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SfnO70456 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SfnO70456 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SfnO70456 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SfnO70456 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SfnO70456 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SfnO70456 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SfnO70456 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SfnO70456 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SfnO70456 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SfnO70456 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SfnO70456 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SfnO70456 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SfnO70456 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SfnO70456 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SfnO70456 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SfnO70456 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SfnO70456 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SfnO70456 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SfnO70456 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SfnO70456 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SfnO70456 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SfnO70456 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SfnO70456 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SfnO70456 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SfnO70456 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SfnO70456 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SfnO70456 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SfnO70456 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SfnO70456 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SfnO70456 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SfnO70456 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SfnO70456 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SfnO70456 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SfnO70456 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SfnO70456 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SfnO70456 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SfnO70456 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SfnO70456 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SfnO70456 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SfnO70456 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SfnO70456 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SfnO70456 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SfnO70456 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SfnO70456 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SfnO70456 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SfnO70456 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SfnO70456 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SfnO70456 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SfnO70456 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SfnO70456 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SfnO70456 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SfnO70456 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SfnO70456 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SfnO70456 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SfnO70456 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SfnO70456 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SfnO70456 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SfnO70456 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SfnO70456 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SfnO70456 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms