Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lnx1O70263 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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