Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AurkbO70126 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkbO70126 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AurkbO70126 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkbO70126 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkbO70126 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkbO70126 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms