Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp26a1O55127 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms