Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LatO54957 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LatO54957 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LatO54957 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LatO54957 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LatO54957 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LatO54957 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LatO54957 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LatO54957 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LatO54957 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LatO54957 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LatO54957 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LatO54957 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LatO54957 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LatO54957 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LatO54957 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LatO54957 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms