Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srpk2O54781 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srpk2O54781 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms