Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrxO54751 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrxO54751 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrxO54751 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrxO54751 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrxO54751 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrxO54751 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrxO54751 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrxO54751 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrxO54751 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrxO54751 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrxO54751 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrxO54751 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrxO54751 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrxO54751 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CrxO54751 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CrxO54751 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CrxO54751 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
CrxO54751 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CrxO54751 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CrxO54751 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CrxO54751 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CrxO54751 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CrxO54751 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CrxO54751 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CrxO54751 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
CrxO54751 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CrxO54751 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CrxO54751 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CrxO54751 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CrxO54751 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CrxO54751 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CrxO54751 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CrxO54751 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CrxO54751 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CrxO54751 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CrxO54751 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CrxO54751 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CrxO54751 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CrxO54751 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CrxO54751 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CrxO54751 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CrxO54751 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CrxO54751 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms